TOKYOn toimintaa pyörittää vuosittain valittava hallitus ja yhdistyksen toiminnanjohtaja. Hallituksen toiminta jakautuu vastuualueisiin, jotka hallituksen jäsenet itse valitsevat. Vuoden loppupuolella pidettävä syyskokous valitsee Aalto ARTSin opiskelijoiden keskuudesta maksimissaan 11-jäsenisen hallituksen, jonka toimikausi kestää vuoden. Käytännössä hallitus on porukka, joka yhdessä toiminnanjohtajan kanssa pyörittää TOKYOn toimintaa.
Hallituksella on ollut tapana kokoontua viikon välein. Hallituksen jäsenet sopivat keskenään vastuualueistaan, joita voivat olla esimerkiksi sosiaali- ja koulutuspoliittiset asiat, kansainväliset asiat, ympäristöasiat, viestintä, Torso-lehti tai vapaa-aika ja bileet eli Sherylin toiminta. Hallituksen vastuualueista voit lukea lisää täällä.